Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas

MARQUES, Diego Ferreira

Dissertação

Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas

Hoplias malabaricus, popularly known as trahira is classified inErythrinidae, Order Characiformes. Cytogenetic studies showed highchromosomal variation among populations,have been classified into seven cytotypes (A-G). Molecular data evidencedhigh levels of genetic diversity and support the hypot...

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Autor principal:	MARQUES, Diego Ferreira
Grau:	Dissertação
Idioma:	pt_BR
Publicado em:	Universidade Federal do Oeste do Pará 2021
Assuntos:	Hoplias malabaricus Complexo de espécies Citogenética. DNABarcode CNPQ::CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA CONSERVAÇÃO E MANEJO DA BIODIVERSIDADE NA AMAZÔNIA
Acesso em linha:	https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/213

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spelling	ir-123456789-2132021-02-18T13:58:39Z Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas MARQUES, Diego Ferreira RODRIGUES, Luis Reginaldo Ribeiro SILVA, Simoni Santos da Hoplias malabaricus Complexo de espécies Citogenética. DNABarcode CNPQ::CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA CONSERVAÇÃO E MANEJO DA BIODIVERSIDADE NA AMAZÔNIA Hoplias malabaricus, popularly known as trahira is classified inErythrinidae, Order Characiformes. Cytogenetic studies showed highchromosomal variation among populations,have been classified into seven cytotypes (A-G). Molecular data evidencedhigh levels of genetic diversity and support the hypothesis of H.malabaricusasa species complex, including independent biological units. Genetic studies in populations of trahiras in the Amazon Basin are scarce and the studies developed so farrarely resolved this species complex.This work describes the molecular and chromosomal diversity in the complex H. malabaricusfrom Amazon basin.Were collected 59 specimens fromeight localities in the lower Amazon River, state of Pará, Brazil.For chromosomal analysis, it was processed conventional staining, C-banding, Ag-NOR staining, CMA3 staining and FISH with 18S rDNA probes. For molecular analysis the genetic distances were accessed from DNA barcodes sequences (gene cox I) using Neighbor-joining with K2P model, and median joining for haplotype network.Thestudy showed the presence of distinct karyotypes with diploid numbers of 40, 41 and 42, that were classified in four cytotypes: A, C, E and G; NORsshowed different number and locations between cytotypes andcollection points. The C-banding pattern was homogeneouswithin each cytotype.DNA Barcode analysis clearly revealed two groups, which canindicate the presence of an undescribed Hoplias in the lower Amazon region.This is the firstwork in the lower amazon that aim to discriminate species of the Hoplias malabaricuscomplex, correlating data with cytogenetic markers andcontributing to the molecular validation of the efficacy of DNA Barcode. CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Hoplias malabaricus, popularmente conhecida como traíra é classificada em Erythrinidae, Ordem Characiformes. Estudos citogenéticos demonstraram grande variação cromossômica entre populações, sendo classificadas em sete citótipos(AG). Dados moleculares evidenciam altos índices de divergência genética e apóiam a hipótese que o táxon nominal Hoplias malabaricus seja um complexo de espécies, formado por unidades biológicas independentes. Os estudos genéticos em populações de traíra na Bacia Amazônica são escassos e todos os trabalhos desenvolvidos até hoje nesse táxon não evidenciam de forma precisa relações moleculares e cromossômicas capazes de discriminar o número real de espécies dentro desse complexo. O presente trabalho visou caracterizar a diversidade cromossômica e molecular utilizando a metodologia do DNA BARCODE no complexo H. malabaricus (Characiformes, Erythrinidae) da região do baixo amazonas. Para isso foram coletados 59espécimes de H. malabaricus de oito localidades da região do baixo amazonas no Estado do Pará. Foram realizadas 53 preparações cromossômicas, análise convencional para descrição do citótipo correspondente, técnicas de bandeamento C, detecção de NOR por marcação com AgNO3 e hibridização por fluorescência (FISH) com sonda rDNA 18S, bem como marcação das regiões ricas em GC por cromomicina (CMA3); para análise molecular foram sequenciadas 54 amostras do gene citocromo oxidase subunidade I (Cox I) sendo que as distâncias genéticas foram estimadas adotando-se os métodos de agrupamento de vizinhos com o modelo K2P, usando-se o programa MEGA e ferramentas online do BOLD.As relações genéticas entre haplótipos foram evidenciadas com o método Median-Joining usando-se o programa NETWORK. O estudo evidenciou a presença de quatro citótipos: A, C, E e G; padrões de NOR evidenciam diferentes marcações tanto entre citótipos quanto entre pontos de coleta sendo o padrão de bandeamento C homogêneo por citótipo. A rede de haplótipos mostra que há fluxo gênico entre as populações e os índices de divergência elevados entre os citótipos A, E e G comparados com o citótipo C, entretanto, não foi possível uma separação total por citótipos quando os quatro foram testados conjuntamente. Por outro lado, a análise de DNA Barcode revelou claramente dois grupos, que podem caracterizar a presença de espécie não descrita na população de H. malabaricus do baixo Amazonas. Este se caracteriza como o primeiro trabalho que visa a discriminação de espécies do complexo Hoplias malabaricus, correlacionando dados com marcadores citogenéticos e moleculares contribuindo na validação da eficácia do DNA Barcode. 2021-02-18T13:57:36Z 2021-02-18T13:57:36Z 2011-03-28 Dissertation MARQUES, Diego Ferreira. Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas. Orientador: Luis Reginaldo Ribeiro Rodrigues. 2011. 72 f. Dissertação (Mestrado em Recursos Naturais da Amazônia) - Programa de Pós-graduação em Recursos Naturais da Amazônia, Universidade Federal do Oeste do Pará, Santarém, 2011. Disponível em: https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/213. Acesso:. https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/213 pt_BR Acesso Aberto Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/ application/pdf Universidade Federal do Oeste do Pará Brasil Programa de Pós-Graduação em Recursos Naturais da Amazônia UFOPA Instituto de Engenharia e Geociências 1 CD-ROM
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Diversidade cromossômica e molecular (DNA BARCODE) no complexo Hoplias malabaricus (CHARACIFORMES, ERYTHRINIDAE) da região do Baixo Amazonas

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