Dissertação

Detecção e monitoramento do Sars-Cov-2 em águas residuárias em Santarém, Pará

Viruses are infectious particles, highly adaptable and capable of infecting different human tissues, such as SARS-CoV-2, (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) responsible for the disease COVID-19. In view of the above, the aim was to monitor and identify the presence of SARS-COV-2 in was...

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Autor principal: OLIVEIRA, Josciane Carneiro
Grau: Dissertação
Idioma: pt_BR
Publicado em: Universidade Federal do Oeste do Pará 2023
Assuntos:
Acesso em linha: https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/816
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spelling ir-123456789-8162023-03-14T19:22:04Z Detecção e monitoramento do Sars-Cov-2 em águas residuárias em Santarém, Pará OLIVEIRA, Josciane Carneiro HENRIQUE, Israel Nunes http://lattes.cnpq.br/3418821931567495 https://orcid.org/0000-0003-2127-5428 LIMA, Marcos Prado http://lattes.cnpq.br/5622909331944063 Pandemia Epidemiologia Águas residuárias COVID-19 CNPQ:: CIÊNCIAS BIOLÓGICAS SOCIEDADE, AMBIENTE E QUALIDADE DE VIDA Viruses are infectious particles, highly adaptable and capable of infecting different human tissues, such as SARS-CoV-2, (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) responsible for the disease COVID-19. In view of the above, the aim was to monitor and identify the presence of SARS-COV-2 in wastewater at strategic points, using a rapid and accurate analytical method. The study occurred in the urban area of Santarem at three sampling points for wastewater collection: (i) EEE of Residencial Salvação (ii) ETE Irurá wet well and (iii) ETE of Hospital Regional. The collection occurred manually, where 500 ml was collected every 12 minutes for 4 h, and at the end 2L of composite sample was obtained. The analyses occurred in parallel with the biweekly collections in the period from March to September 2021, totaling 13 determinations. In the Laboratory of Wastewater Treatment the physical-chemical parameters of the samples were analyzed (Temperature, pH, Alkalinity, Dissolved Oxygen, Phosphorus, Solids, Nitrogen, Ammonia, Chemical Oxygen Demand, Nitrite, and Nitrate) and submitted to the analytical methods of the Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. In the Molecular Biology Laboratory the samples went through four steps: virus concentration by the hydrophilic MCE electronegative membrane filtration method (0. 45-μm-pore-size membrane filtration method); RNA extraction with the commercial Maxwell RSC Viral Total Nucleic Acid Purification Kit, detection and quantification of the virus by reverse transcription reaction and real-time DNA polymerase chain reaction (PCR) performed in the 7500 Real Time PCR System equipment, which used the commercial Bio-Manguinhos SARS-CoV-2 (E/RP) Molecular Kit. The wastewater from the three treatment plants presented peculiar physical-chemical characteristics for virus reduction, such as temperature, COD, and solids. The qualitative application for the detection of the SARS-CoV-2 virus RNA molecule was for positive or negative diagnosis (+/-) and quantitative for absolute quantification (viral load/number of copies). The virus was detected in 24% of samples, with the highest number of positive samples in the hospital, there was no presence in the TEE, and only one sample was positive in the EEE. The study found that it is possible to perform wastewater-based epidemiological monitoring for the detection of the SARS-CoV-2 viral load at strategic points of sewage disposal. CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior Os vírus são partículas infecciosas, altamente adaptáveis e capazes de infectar diferentes tecidos humanos, como o SARS-CoV-2, (Síndrome Respiratória Aguda Grave Coronavírus 2) responsável pela doença COVID-19. Diante do exposto, objetivou-se monitorar e identificar a presença SARS-COV-2 em águas residuárias em pontos estratégicos, com uso de método analítico, rápido e preciso. O estudo ocorreu na área urbana de Santarém em três pontos amostrais para coleta de águas residuais: (i) EEE do Residencial Salvação (ii) Poço úmido ETE Irurá e (iii) ETE do Hospital Regional. A coleta ocorreu de forma manual, onde a cada 12 minutos coletou-se 500 ml durante 4 h, e no final obteve-se 2L de amostra composta. As análises ocorreram paralelamente com as coletas quinzenalmente no período de março a setembro de 2021, totalizando 13 determinações. No Laboratório de Tratamento de Águas Residuárias foram analisados os parâmetros físico-químico das amostras (Temperatura; pH; Alcalinidade; Oxigênio Dissolvido; Fósforo; Sólidos; Nitrogênio, Amônia; Demanda Química de Oxigênio, Nitrito e Nitrato) e submetidas aos métodos analíticos do Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. No Laboratório de Biologia Molecular as amostras passaram por quatro etapas: concentração do vírus pelo método de filtração por membrana eletronegativa MCE hidrofílica (0.45-μm-pore-size); extração do RNA com o kit comercial Maxwell RSC Viral Total Nucleic Acid Purification Kit , detecção e quantificação do vírus por meio de reação Transcrição Reversa e Reação em Cadeia da DNA polimerase (PCR) em tempo real realizada no equipamento 7500 Real Time PCR System, no qual utilizou-se o kit comercial Kit Molecular SARS-CoV-2 (E/RP) Bio-Manguinhos. As águas residuárias das três estações de tratamento apresentaram características físico-química peculiares para a diminuição do vírus, como a temperatura, a DQO e os sólidos. A aplicação qualitativa para a detecção da molécula de RNA do vírus SARS-CoV-2 foi para o diagnóstico positivo ou negativo (+/-) e quantitativa para a quantificação absoluta (carga viral/nº cópias). O vírus foi detctado em 24% das amostras, com maior número de amostras positivas no hospital, não houve presença na ETE, e apenas uma amostra foi positiva na EEE. O estudo constatou que é possível realizar o monitoramento epidemiológico baseado em águas residuárias para a detecção da carga viral do vírus SARS-CoV-2 em pontos estratégicos de esgotamento sanitário. 2023-03-14T19:20:55Z 2023-03-14T19:20:55Z 2022-03-09 Dissertation OLIVEIRA, Josciane Carneiro. Detecção e monitoramento do Sars-Cov-2 em águas residuárias em Santarém, Pará. Orientador: Israel Nunes Henrique. Coorientador: Marcos Prado Lima. 2022.79f. Dissertação (Mestrado em Sociedade, Ambiente e Qualidade de Vida) - Programa de Pós-Graduação em Sociedade, Ambiente e Qualidade de Vida, Universidade Federal do Oeste do Pará, Santarém, 2022. Disponível em: https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/816 https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/816 pt_BR Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Oeste do Pará Brasil Programa de Pós-Graduação em Sociedade, Ambiente e Qualidade de Vida UFOPA Centro de Formação Interdisciplinar 1 CD-ROM
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