Dissertação

Filogenia molecular dos xenarthra (Mammalia): análise do grupo cingulata a partir de sequências nucleotídicas do gene mitocondrial rRNA 16S

Xenarthra is the group of mammals which include armadillos, anteaters and sloths. South America was the landscape of their natural history. Only toward the end of the Cenozoic they spread from South America to Cen-tral America and, in decreasing variety, farther in North America and to some of the W...

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Autor principal: PAMPLONA NETO, Christóvam
Grau: Dissertação
Idioma: por
Publicado em: Universidade Federal do Pará 2013
Assuntos:
Mamíferos
Xenarthra
Tatu
Tamanduá
Preguiça
Gene 16S
Cingulata
Filogenia molecular
Brasil - País
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA
Acesso em linha: http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/4232
id ir-2011-4232
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spelling ir-2011-42322017-12-22T13:27:31Z Filogenia molecular dos xenarthra (Mammalia): análise do grupo cingulata a partir de sequências nucleotídicas do gene mitocondrial rRNA 16S PAMPLONA NETO, Christóvam SCHNEIDER, Horacio http://lattes.cnpq.br/3621033429800270 Mamíferos Xenarthra Tatu Tamanduá Preguiça Gene 16S Cingulata Filogenia molecular Brasil - País CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::ZOOLOGIA APLICADA Xenarthra is the group of mammals which include armadillos, anteaters and sloths. South America was the landscape of their natural history. Only toward the end of the Cenozoic they spread from South America to Cen-tral America and, in decreasing variety, farther in North America and to some of the West Indian islands. The 31 extant species are described within xenarthran lineage. They are distributed in 13 genera, four families (Brady-podidae, Magelonychidae, Myrmecophagidae and Dasypodidae) and two or-ders orders (Cingulata and Pilosa). The phylogeny of this group has been addressed by multiple researchers using both morphological and molecular data sets. Through phylogenetic analyses of protein-coding nuclear genes and mitochondrial genes, Delsuc et al. (2003) found evidence for the hy-pothesis of monophyly of the subfamilies Dasypodinae, Tolypeutinae and Euphactinae within the family Dasypodidae. They had generated the fol-lowing tree: (((Bradypus, Choloepus)100, ((Myrmecophaga, Tamandua)100, Cyclopes)100), ((D. kappleri, D. novemcinctus)100, (Tolypeutes, (Priodontes, Cabassous)54)100, (Zaedyus, (Euphractus, Chaetophractus)60)100)). Gaudin (2005) presented a work that reviewed and extended the morphological data available, concluding that the extant armadillos are divided in two groups, a basal group (Dasypodinae) and another more derivative (Euphractinae), in accordance with the following arrangement: (Bradypus, Tamandua), (Dasy-pus, (Priodontes, (Cabassous, (Tolypeutes, (Euphractus, Chaetophractus, (Za-edyus, Ch/amyphorus)42)36)72)72)40)85). In the work described in this dis-sertation, we sequenced part of the 16S rRNA mitochondrial gene from 12 extant taxa of Xenarthra to perform phylogeny analysis based on maximum-likelihood. Our results are presented analysing the 16S gene data alone, an concatenated with the dataset of Delsuc et al. (2003): (Bradypus, (Choloe-pus, ((Cyclopes, (Myrmecophaga, Tamandua)100)100, (Dasypus, (((Cabas-sous, Priodontes)68, Tolypeutes)100,((Chaetophractus, Euphractus)65, Za-edyus)100)100)100)100)100). Results were similar to those of previous stu-dies. However, an improvement in bootstrap values of certain branches could be noticed. We believe that Transposable Elements (UNES) are the molecular markers more adjusted to confirm uncertain arrangements sugges-ted by phylogenetic analyses mitocondrials and nuclear genes. Os Xenarthra são o grupo de mamíferos que inclui os tatus, os tamanduás e as preguiças. A América do Sul serviu de cenário para a história natural do grupo que, somente no fim do Cenozóico, dispersou-se para a América Central e, com uma perda de variedade, chegou à América do Norte e à algu-mas ilhas do Caribe. Trinta e uma espécies estão descritas dentro da linha-gem dos Xenarthra. Elas estão classificadas em 13 gêneros, quatro famílias (Bradypodidae, Megalonychidae, Myrmecophagidae e Dasypodidae) e duas ordens (Cingulata e Pilosa). A filogenia deste grupo tem sido alvo de diver-sas pesquisas que analisaram tanto dados morfológicos, quanto moleculares. Delsuc et al. (2003) analisaram seqüências de genes mitocondriais e nucleares e confirmaram a monofilia das três subfamílias (Dasypodinae, Euphacti-nae e Tolypeutinae) inclusas na família Dasypodidae. Delsuc et al. (2003) geraram a seguinte árvore: (((Bradypus, Choloepus)100, ((Myrmecophaga, Tamandua)100, Cyclopes)100), ((D. kappleri, D. novemcinctus)100, (Toly-pentes, (Priodontes, Cabassous)54)100, (Zaedyus, (Euphractus, Chaetophrac-tus)60)100)). Gaudin (2005) apresentou um trabalho que reviu e ampliou as análises morfológicas apresentadas até então, concluindo que os tatus atu-ais estão divididos em dois grupos, um mais basal (Dasypodinae) e outro mais derivado (Euphractinae), de acordo com o seguinte arranjo: (Bradypus, Tamandua), (Dasypus, (Priodontes, (Cabassous, (Tolypeutes, (Euphractus, Chaetophractus, (Zaedyus, Chlamyphorus)42)36)72)72)40)85). Neste traba-lho utilizou-se parte do gene mitocondrial rRNA 16S de 12 táxons atu-ais de Xenarthra para analisar a filogenia do grupo através do critério de máxima verossimilhança. Nossos resultados são apresentados analisando-se o gene 16S e analisando o banco de dados do 16S mais o de Delsuc et al. (2003). Nas duas situações, as filogenias apresentadas apóiam os resulta-dos de Delsuc et al. (2003): (Bradypus, (Choloepus, ((Cyclopes, (Myrme-cophaga, Tamandua)100)100, (Dasypus, (((Cabassous, Priodontes)68, Toly-peutes)100,((Chaetophractus, Euphractus)65, Zaedyus)100)100)100)100)100). Uma melhora nos valores de bootstrap nos ramos dentro das sub-famílias da família Dasypodidae é percebida em relação ao trabalho de Delsuc et al. (2003). Acreditamos que Elementos de Transposição do tipo (LINES) são os marcadores moleculares mais adequados para confirmar o arranjo obtido com as seqüências de genes mitocondriais e nucleares. 2013-09-10T13:28:58Z 2013-09-10T13:28:58Z 2007-05-01 Dissertação PAMPLONA NETO, Christóvam. Filogenia molecular dos xenarthra (Mammalia): análise do grupo cingulata a partir de sequências nucleotídicas do gene mitocondrial rRNA 16S. 2007. 84 f. Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Pará, Museu Paraense Emílio Goeldi, Belém, 2007. Programa de Pós-Graduação em Zoologia. http://repositorio.ufpa.br/jspui/handle/2011/4232 por Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Pará Museu Paraense Emílio Goeldi Brasil Instituto de Ciências Biológicas UFPA MPEG Programa de Pós-Graduação em Zoologia
institution Repositório Institucional - Universidade Federal do Pará
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description Xenarthra is the group of mammals which include armadillos, anteaters and sloths. South America was the landscape of their natural history. Only toward the end of the Cenozoic they spread from South America to Cen-tral America and, in decreasing variety, farther in North America and to some of the West Indian islands. The 31 extant species are described within xenarthran lineage. They are distributed in 13 genera, four families (Brady-podidae, Magelonychidae, Myrmecophagidae and Dasypodidae) and two or-ders orders (Cingulata and Pilosa). The phylogeny of this group has been addressed by multiple researchers using both morphological and molecular data sets. Through phylogenetic analyses of protein-coding nuclear genes and mitochondrial genes, Delsuc et al. (2003) found evidence for the hy-pothesis of monophyly of the subfamilies Dasypodinae, Tolypeutinae and Euphactinae within the family Dasypodidae. They had generated the fol-lowing tree: (((Bradypus, Choloepus)100, ((Myrmecophaga, Tamandua)100, Cyclopes)100), ((D. kappleri, D. novemcinctus)100, (Tolypeutes, (Priodontes, Cabassous)54)100, (Zaedyus, (Euphractus, Chaetophractus)60)100)). Gaudin (2005) presented a work that reviewed and extended the morphological data available, concluding that the extant armadillos are divided in two groups, a basal group (Dasypodinae) and another more derivative (Euphractinae), in accordance with the following arrangement: (Bradypus, Tamandua), (Dasy-pus, (Priodontes, (Cabassous, (Tolypeutes, (Euphractus, Chaetophractus, (Za-edyus, Ch/amyphorus)42)36)72)72)40)85). In the work described in this dis-sertation, we sequenced part of the 16S rRNA mitochondrial gene from 12 extant taxa of Xenarthra to perform phylogeny analysis based on maximum-likelihood. Our results are presented analysing the 16S gene data alone, an concatenated with the dataset of Delsuc et al. (2003): (Bradypus, (Choloe-pus, ((Cyclopes, (Myrmecophaga, Tamandua)100)100, (Dasypus, (((Cabas-sous, Priodontes)68, Tolypeutes)100,((Chaetophractus, Euphractus)65, Za-edyus)100)100)100)100)100). Results were similar to those of previous stu-dies. However, an improvement in bootstrap values of certain branches could be noticed. We believe that Transposable Elements (UNES) are the molecular markers more adjusted to confirm uncertain arrangements sugges-ted by phylogenetic analyses mitocondrials and nuclear genes.
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