Análise de parentesco em filhotes de pirarucu (Arapaima gigas Cuvier, 1817), utilizando marcadores microssatélites.
Arapaima gigas, conhecido no Brasil como pirarucu, é uma das espécies economicamente mais importantes da bacia Amazônica. No entanto, o conhecimento sobre alguns aspectos da biologia, comportamento e crescimento, em qualquer modalidade de criação intensiva, ainda é escasso. O pirarucu apresenta...
| Autor principal: | Almeida, Yane Santos |
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| Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/4550855155546150 |
| Grau: | Dissertação |
| Idioma: | por |
| Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2015
|
| Assuntos: | |
| Acesso em linha: |
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4391 |
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oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-43912016-06-10T12:52:16Z Análise de parentesco em filhotes de pirarucu (Arapaima gigas Cuvier, 1817), utilizando marcadores microssatélites. Almeida, Yane Santos Farias, Izeni Pires http://lattes.cnpq.br/4550855155546150 http://lattes.cnpq.br/7673734418642222 Arapaima gigas Microssatélites Sistema reprodutivo Estimas de relacionamento Arapaima gigas Microsateliite Reproductive system Relationship CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Arapaima gigas, conhecido no Brasil como pirarucu, é uma das espécies economicamente mais importantes da bacia Amazônica. No entanto, o conhecimento sobre alguns aspectos da biologia, comportamento e crescimento, em qualquer modalidade de criação intensiva, ainda é escasso. O pirarucu apresenta um comportamento reprodutivo complexo e durante esse período, observações de criadores e de outros autores afirmam que: ocorre a formação de casais, construção de ninhos e o cuidado parental da prole que é realizado pelo macho. O presente trabalho teve o intuito de fornecer informações sobre o parentesco genético, entre filhotes de pirarucu, provenientes de áreas de cativeiro e de área semi-aberta (Santarém), utilizando marcadores microssatélites. A técnica mencionada tem sido a ferramenta molecular mais utilizada pelos pesquisadores para revelar níveis de relacionamento genético dentro e entre grupos de irmãos e parentes mais próximos. As análises de parentesco foram feitas utilizando-se nove (os mais polimórficos) microssatélites desenvolvidos para A. gigas. As genotipagens foram realizadas no seqüenciador automático de DNA MegaBace 1000 utilizando-se o programa Genetic Profiler v1.2. As freqüências alélicas e os valores de heterozigosidade esperadas e observadas foram obtidos através do programa ARLEQUIN e GENETIX v. 4. Genótipos para todos os filhotes das duas ninhadas, foram usados para calcular os coeficientes de relacionamento dos pares e a relação de parentesco, usando o programa de computador KITNSHIP v1.2, baseado em todos os locos. As categorias de relacionamento foram estimadas usando o programa ML-RELATE. Nossos resultados indicaram que as ninhadas, das áreas de cativeiro apresentaram, em média, estimativas altas de relacionamento, variando de 0,48 em Itacoatiara 2 e Rio Preto da Eva a 0,51 em Itacoatiara 1. Nas amostras de Santarém, os valores médios encontrados variaram de 0,46 a 0,80 em STM G2 e STM G3, respectivamente. As matrizes das categorias de relacionamento, mostram que tanto nos grupos de cativeiro, como nos grupos de área semi-aberta, a maior freqüência observada nos filhotes é da categoria não-relacionados (U). Quando analisamos separadamente cada amostragem, percebemos outros níveis de relações de parentesco ou categorias de relacionamento nos filhotes. Esses resultados indicam que, apesar dos filhotes estarem altamente relacionados, a hipótese de uma “maternidade ou paternidade extra” aos pares do acasalamento, não pode ser ignorada. Tais resultados demonstram uma estratégia reprodutiva natural e efetiva, para a manutenção da variabilidade genética na prole de Arapaima gigas. Arapaima gigas, known in Brazil as pirarucu, is on of the most economically important species in the Amazon watershed. However there is scarce knowledge of some aspects of its biology, behavior and growing rates in any modality of intensive farming. Pirarucu presents a complex reproductive behavior, including formation of couples; nest building; and parental care by male, as observed by farmers and other authors. The present work aim to generate information about genetic kinship between nestling of pirarucu from captivity and semi-open areas (Santarém), by means of microsatellite markers. This technique is the most used molecular marker to reveal leveis or genetic relationships within and between group of brothers and dose relatives. Kinship analyses were carried out with nine (the most polymorphic) microsatellite developed for A. gigas. The genotypes were done in the automatic DNA sequencer MegaBace 1000 using the software Genetic Profiler v1.2. Allelic frequencies and expected and observed heterozigosity values were obtained in the software ARLEQUIN and GENETIX v. 4. Genotypes of all the nestling of two offspring were used to calculate the pairwise kinship relationships and kinship relationships using the software KINSHIP vl. 2, based on all loci. The reitionships categories were estimated in the sofiware ML-RELATE. Our results indicated that, on average, the captivity offspring presented a high estimative of relationship, varying from 0.48 in Itacoatiara 2 e Rio Preto da Eva, to 0.51 in Itacoatiara 1. In Santarém samples, the average values varied from 0,46 to 0,80 in STM G2 e STM G3, respectiveiy. The relationship categories matrixes show that the higher frequency observed in nestling is the category of non-related (U), both in captivity groups as semi-open areas groups. When we analyzed separately each sample, we find other level of kinship reiationships or kinship categories in the nestling. These results indicate that, despite the nestling are highly related, the hypotheses of an “extra maternity or paternity” of the pair of reiationship can not be ignored. These results demonstrate a reproductive strategy natural and effective to keep the genetie variability in the nestling of Arapaima gigas. CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico 2015-07-16T15:44:31Z 2006-10-26 Dissertação ALMEIDA, Yane Santos. Análise de parentesco em filhotes de pirarucu (Arapaima gigas Cuvier, 1817), utilizando marcadores microssatélites. 2006. 70f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2006. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4391 por Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia |
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TEDE - Universidade Federal do Amazonas |
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Arapaima gigas, conhecido no Brasil como pirarucu, é uma das espécies
economicamente mais importantes da bacia Amazônica. No entanto, o
conhecimento sobre alguns aspectos da biologia, comportamento e
crescimento, em qualquer modalidade de criação intensiva, ainda é escasso. O
pirarucu apresenta um comportamento reprodutivo complexo e durante esse
período, observações de criadores e de outros autores afirmam que: ocorre a
formação de casais, construção de ninhos e o cuidado parental da prole que é
realizado pelo macho. O presente trabalho teve o intuito de fornecer
informações sobre o parentesco genético, entre filhotes de pirarucu,
provenientes de áreas de cativeiro e de área semi-aberta (Santarém), utilizando
marcadores microssatélites. A técnica mencionada tem sido a ferramenta
molecular mais utilizada pelos pesquisadores para revelar níveis de
relacionamento genético dentro e entre grupos de irmãos e parentes mais
próximos. As análises de parentesco foram feitas utilizando-se nove (os mais
polimórficos) microssatélites desenvolvidos para A. gigas. As genotipagens
foram realizadas no seqüenciador automático de DNA MegaBace 1000
utilizando-se o programa Genetic Profiler v1.2. As freqüências alélicas e os
valores de heterozigosidade esperadas e observadas foram obtidos através do
programa ARLEQUIN e GENETIX v. 4. Genótipos para todos os filhotes das
duas ninhadas, foram usados para calcular os coeficientes de relacionamento
dos pares e a relação de parentesco, usando o programa de computador
KITNSHIP v1.2, baseado em todos os locos. As categorias de relacionamento
foram estimadas usando o programa ML-RELATE. Nossos resultados
indicaram que as ninhadas, das áreas de cativeiro apresentaram, em média,
estimativas altas de relacionamento, variando de 0,48 em Itacoatiara 2 e Rio
Preto da Eva a 0,51 em Itacoatiara 1. Nas amostras de Santarém, os valores
médios encontrados variaram de 0,46 a 0,80 em STM G2 e STM G3,
respectivamente. As matrizes das categorias de relacionamento, mostram que
tanto nos grupos de cativeiro, como nos grupos de área semi-aberta, a maior
freqüência observada nos filhotes é da categoria não-relacionados (U). Quando
analisamos separadamente cada amostragem, percebemos outros níveis de
relações de parentesco ou categorias de relacionamento nos filhotes. Esses
resultados indicam que, apesar dos filhotes estarem altamente relacionados, a
hipótese de uma “maternidade ou paternidade extra” aos pares do
acasalamento, não pode ser ignorada. Tais resultados demonstram uma
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