Tese

Combinatorial Approaches for the Closest String Problem

O problema da cadeia de caracteres mais próxima (do inglés Closest String Problem CSP) que surge na bioinformática e na criptografia é encontrar uma cadeia de caracteres que minimize a maior distância de Hamming de um determinado conjunto de cadeias de caracteres, o CSP é um problema NP-difícil. O p...

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Autor principal: Vilca, Omar Latorre
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/3293662600883484
Grau: Tese
Idioma: por
Publicado em: Universidade Federal do Amazonas 2019
Assuntos:
Acesso em linha: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7449
Resumo:
O problema da cadeia de caracteres mais próxima (do inglés Closest String Problem CSP) que surge na bioinformática e na criptografia é encontrar uma cadeia de caracteres que minimize a maior distância de Hamming de um determinado conjunto de cadeias de caracteres, o CSP é um problema NP-difícil. O principal objetivo deste trabalho é propor métodos exatos para este problema, para esse fim, caracterizamos casos especiais para esse problema com ênfase no número de strings. Até agora, nossa contribuição é: algoritmos de tempo linear para o CSP com até três strings e para quatro strings binárias, além de um algoritmo guloso heurístico e um algoritmo exato recursivo para o caso geral. Além disso, para cada algoritmo proposto serão apresentadas provas formais de corretude, também experimentos numéricos mostrarão a eficácia dos algoritmos propostos.