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Tese
Combinatorial Approaches for the Closest String Problem
O problema da cadeia de caracteres mais próxima (do inglés Closest String Problem CSP) que surge na bioinformática e na criptografia é encontrar uma cadeia de caracteres que minimize a maior distância de Hamming de um determinado conjunto de cadeias de caracteres, o CSP é um problema NP-difícil. O p...
Autor principal: | Vilca, Omar Latorre |
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Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/3293662600883484 |
Grau: | Tese |
Idioma: | por |
Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2019
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Assuntos: | |
Acesso em linha: |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7449 |
Resumo: |
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O problema da cadeia de caracteres mais próxima (do inglés Closest String Problem CSP) que surge na bioinformática e na criptografia é encontrar uma cadeia de caracteres que minimize a maior distância de Hamming de um determinado conjunto de cadeias de caracteres, o CSP é um problema NP-difícil. O principal objetivo deste trabalho é propor métodos exatos para este problema, para esse fim, caracterizamos casos especiais para esse problema com ênfase no número de strings. Até agora, nossa contribuição é: algoritmos de tempo linear para o CSP com até três strings e para quatro strings binárias, além de um algoritmo guloso heurístico e um algoritmo exato recursivo para o caso geral. Além disso, para cada algoritmo proposto serão apresentadas provas formais de corretude, também experimentos numéricos mostrarão a eficácia dos algoritmos propostos. |