Dissertação

Identificação e análise de polimorfismo em genes relacionados ao estresse oxidativo em tambaqui (Colossoma macropomum)

Para sobreviver em ambientes ricos em oxigênio, os organismos aeróbicos precisam de um sistema de defesa eficaz contra espécies reativas de oxigênio (ROS). Embora as concentrações fisiológicas de ROS em organismos aeróbicos sejam benéficas e envolvam vias de sinalização celular e sobrevivência de pa...

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Autor principal: Ramos, Gilvan da Costa
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/8635236582350509, 8635236582350509
Grau: Dissertação
Idioma: por
Publicado em: Universidade Federal do Amazonas 2022
Assuntos:
Stress oxidativo
Tambaqui (Peixe)
Polimorfismo (Genética)
CIENCIAS AGRARIAS: ZOOTECNIA
Estresse oxidativo
Vias metabólicas
Genes
Oxigênio
Acesso em linha: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8954
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spelling oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-89542022-07-08T05:03:34Z Identificação e análise de polimorfismo em genes relacionados ao estresse oxidativo em tambaqui (Colossoma macropomum) Ramos, Gilvan da Costa Nunes, José de Ribamar da Silva http://lattes.cnpq.br/8635236582350509 http://lattes.cnpq.br/2121107059793931 Goll, Leonardo Gusso Moreira, Gabriel Costa Monteiro 8635236582350509 Stress oxidativo Tambaqui (Peixe) Polimorfismo (Genética) CIENCIAS AGRARIAS: ZOOTECNIA Estresse oxidativo Vias metabólicas Genes Oxigênio Para sobreviver em ambientes ricos em oxigênio, os organismos aeróbicos precisam de um sistema de defesa eficaz contra espécies reativas de oxigênio (ROS). Embora as concentrações fisiológicas de ROS em organismos aeróbicos sejam benéficas e envolvam vias de sinalização celular e sobrevivência de patógenos invasores, uma concentração elevada e desequilibrada de ROS pode contribuir para o desenvolvimento de doenças. Quando a produção de ROS excede a capacidade do organismo de eliminar estas espécies reativas usando antioxidantes, ocorre estresse oxidativo. Para proteger contra ROS, potencialmente altamente prejudiciais, os organismos desenvolveram um sistema para prevenir ou reparar os efeitos do estresse oxidativo, podem ser moléculas enzimáticas ou não enzimáticas. Como todos os outros organismos, os animais aquáticos devem ter um equilíbrio entre a produção de ROS e as defesas antioxidantes. O estudo dos mecanismos de controle do estresse oxidativo em peixes é de particular interesse por esses organismos serem expostos a muitos fatores de estresse, tais como variações de temperatura, estresse osmótico, mudanças na disponibilidade de oxigênio, poluição e outros impactos antropogênicos, que podem afetá-los diretamente em seu equilíbrio oxidativo. O tambaqui, Colossoma macropomum, é uma espécie migratória nativa das bacias dos rios Amazonas e Orinoco. Tem boa adaptação à aquicultura, alta taxa de crescimento, tolerância à baixa qualidade da água e excelente aceitação no mercado, e estas características facilitaram sua introdução em várias regiões brasileiras. A diversificação dos ambientes de cultivo criou um cenário promissor para o aumento da pressão seletiva sobre os genes relacionados com a resposta ao estresse oxidativo. Um total de 146.743 SNPs foi obtido e alinhado com BLAST, gerando 311 alinhamentos genotípicos em 229 animais, com sequências de DNA relacionadas a genes envolvidos no processo de resposta ao estresse oxidativo. Após a aplicação do filtro de frequência de alelo (MAF) maior que 0,05 e taxa de retirada de amostra e marcadores > 80%, 169 marcadores genotipados permaneceram em 211 animais. As 169 sequências permitiram o alinhamento com 56 genes de 40 espécies diferentes para 224 alinhamentos. Identificamos variações em importantes genes de resposta ao estresse oxidativo em peixes. A avaliação da resposta genética do tambaqui às pressões seletivas sofridas pelas populações criadas em diferentes regiões do Brasil nos ajuda a compreender a capacidade de adaptação desta espécie aos estressores que podem prejudicar sua produção. Aerobic organisms need an effective defense system against reactive oxygen species (ROS) to survive in oxygen-rich environments. Although physiological concentrations of ROS in aerobic organisms are beneficial and involve cell signaling pathways and survival of invading pathogens, an elevated and unbalanced concentration of ROS can contribute to disease development. When ROS production exceeds the body's ability to eliminate these reactive species using antioxidants, oxidative stress occurs. To protect against damaging ROS, the aerobic organisms have developed a system to prevent or repair the effects of oxidative stress, and these can be enzymatic or non-enzymatic molecules. Like all other organisms, aquatic animals must balance ROS production and antioxidant defenses. The study of the mechanisms controlling oxidative stress in fish is of particular interest because these organisms are exposed to many stressors, such as temperature variations, osmotic stress, changes in oxygen availability, pollution, and other anthropogenic impacts, which can directly affect their oxidative balance. The tambaqui, Colossoma macropomum, is a migratory species native to the Amazon and Orinoco River basins. It has good adaptation to aquaculture, a high growth rate, tolerance to low water quality, and excellent market acceptance, and these characteristics have facilitated its introduction into several Brazilian regions. The diversification of the cultural environments has created a promising scenario for increased selective pressure on genes related to the oxidative stress response. A total of 146,743 SNPs were obtained and aligned with BLAST, generating 311 genotype alignments in 229 animals, with DNA sequences related to genes involved in the oxidative stress response process. After applying the allele frequency filter (MAF) greater than 0.05 and sample and marker recall rate > 80%, 169 genotyped markers remained in 211 animals. The 169 sequences allowed alignment with 56 genes from 40 different species for 224 alignments. We identified variation in important oxidative stress response genes in fish. The evaluation of the genetic response of tambaqui to the selective pressures suffered by populations bred in different regions of Brazil helps us understand this species's ability to adapt to stressors that may impair its production. FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas 2022-07-07T18:45:12Z 2022-04-13 Dissertação RAMOS, Gilvan da Costa. Identificação e análise de polimorfismo em genes relacionados ao estresse oxidativo em tambaqui (Colossoma macropomum). 2022. 51 f. Dissertação (Mestrado em Ciência Animal e Recursos Pesqueiros) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus (AM), 2022. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8954 por Acesso Aberto http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ application/pdf Universidade Federal do Amazonas Faculdade de Ciências Agrárias Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal e Recursos Pesqueiros
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