Nas plantas em geral e nas espécies tropicais, em particular, estudos envolvendo análise filogeográfica são recentes e considerados muito importantes devido ao grande interesse em elucidar os fatores que determinam a estrutura genética atual das populações de plantas Esta informação está começando a ser gerada na Amazônia para espécies como: mandioca, caiaué, guaraná, pupunha, cacau, açaí-do-pará etc., mas a maioria das espécies ainda carece de qualquer informação genética. Dentre estas se destacam o açaí-do-amazonas (Euterpe precatoria), pupunha (Bactris gasipaes) e o tucumã-do-Amazonas (Astrocaryum aculeatum). Muita informação pode ser obtida rapidamente com o uso de marcadores moleculares baseados em sequências polimórficas de genoma de cloroplasto (cpDNA) que são especialmente úteis na compreensão da variabilidade e estrutura genética das populações, gerando informação para a conservação e melhoramento genético. Portanto, esta proposta buscará desenvolver e caracterizar marcadores microssatélites de cloroplastos para apoiar os estudos sobre a variabilidade e estrutura genética deste conjunto de espécies amazônicas, bem como obterá informação visando entender a dinâmica evolutiva das mesmas para apoiar sua conservação, tanto in situ como ex situ, e seu manejo nas comunidades da Amazônia Central.
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