No intuito de avaliar a distribuição da variabilidade genética existente nas populações das espécie de Pyrrhulina brevis (Characiformes: Lebiasinidae), grupo de organismos de pequeno porte, abundante e de ampla distribuição entre ambientes relacionados aos igarapés, optou-se por utilizar marcadores tipo RAPD, pois são marcadores arbitrários, polimórficos, inespecíficos, abrangem todo o genoma e não tem a necessidade de equipamentos e tecnologias moleculares muito sofisticadas e conhecimento prévio de genoma alvo, podendo-se encontrar altos níveis de polimorfismos, possibilitando análises populacionais abrangentes de maneira rápida, simples, confiável e relativamente barata, quando comparados com outros métodos marcadores de DNA. A caracterização de espécies encontradas em igarapés, como as do gênero Pyrrhulina, se faz importante porque auxiliam nas pesquisas que pretendem acessar a variabilidade genética, estrutura populacional e comportamento evolutivo e filogeográfico de organismos habitantes de ambientes tão pouco estudados sobre este aspecto, como os igarapés, servindo na elucidação da dinâmica e padrões biológicos de espécies relacionadas e associados às condições inerentes deste tipo de ambiente, tão numeroso e pouco estudado. A espécie P. brevis (Characiformes: Lebiasinidae) possui ampla distribuição, abundância e pequeno porte, que é o biótipo comum na maioria das espécies de peixes de igarapés, ambiente importante para o ciclo reprodutivo e de vida de muitas espécies, servindo como fonte energética primária ou de base, berçário e refúgio durante as épocas de cheia e vazante, funcionando, também, como o principal sistema de manutenção biológica, drenagem e irrigação dos grandes rios, auxiliando na qualidade dos estoques pesqueiros, cuja comunidade ribeirinha e comerciantes regionais são dependentes para a sobrevida e trabalho. Contudo, por serem pequenos e numerosos, estes ambientes ainda são negligenciados e tem sua dinâmica desconhecida, sendo os dados de origem genética quase que inexistentes. Diversos estudos têm sido feitos em igarapés quanto à ocupação dos nichos pelas as espécies e as mudanças nas diversidades, riqueza e abundância das espécies ao longo das estações climáticas da Amazônia, no entanto, nenhum estudo foi desenvolvido ao nível genético relacionado a distribuição dos indivíduos de uma espécie em relação ao curso de água e sua capacidade e estratégias de locomoção e transposição de supostas barreiras biológicas de espécies de peixes de pequeno porte, morfologia da maioria das espécies de igarapés. Dessa forma, elucidações sobre o relacionamento genético entre os indivíduos de uma espécie em relação a sua distribuição geográfica, como os igarapés, podem servir como um modelo e significar informações sobre hábitos, capacidades biológicas e padrões evolutivos de muitas espécies de peixes e de igarapés similares entre si.
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