Tese

Detecção e distribuição temporal de espécies de peixes em lagos de várzea na Amazônia central utilizando dna ambiental (DNAa)

The fish community in four floodplain lakes located on the island of Paciência, Iranduba, in the state of Amazonas, was studied for its detection and temporal distribution using the pioneer method in the Amazon, called environmental DNA (DNAe). The pre-amplification methodology was developed by test...

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Autor principal: Bevilaqua, Danniel
Grau: Tese
Idioma: por
Publicado em: Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA 2020
Assuntos:
DNA ambiental
ictiofauna
Acesso em linha: https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/19797
http://lattes.cnpq.br/4102952736351817
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spelling oai:repositorio:1-19797 Detecção e distribuição temporal de espécies de peixes em lagos de várzea na Amazônia central utilizando dna ambiental (DNAa) Bevilaqua, Danniel Freitas, Carlos Batista, Jacqueline DNA ambiental ictiofauna The fish community in four floodplain lakes located on the island of Paciência, Iranduba, in the state of Amazonas, was studied for its detection and temporal distribution using the pioneer method in the Amazon, called environmental DNA (DNAe). The pre-amplification methodology was developed by testing dilutions of DNag, then primers and species-specific probes were designed and synthesized for two target species: Prochilodus nigricans and Potamorhina altamazonica, and primers for Triportheus angulatus and Psectrogaster rutiloides. All primers were tested in silico, in vitro and in situ and validated, with this the presence or absence of the target species was detected and with the metabarcode approach the presence of other fish species, in addition to other organisms, present in the lakes in the dry and flood periods. Estudou-se a comunidade de peixes em quatro lagos de várzea localizados na ilha da Paciência, Iranduba, no estado do Amazonas, quanto a sua detecção e distribuição temporal utilizando o método pioneiro na Amazônia, chamado DNA ambiental (DNAa) – Environmental DNA (DNAe). Foi desenvolvido a metodologia de pré-amplificação testando diluições de DNag, em seguida foi desenhado e sintetizado primers e sondas espécie-específicos para duas espécies alvos: Prochilodus nigricans e Potamorhina altamazonica, e primers para Triportheus angulatus e Psectrogaster rutiloides. Todos os primers foram testados in silico, in vitro e in situ e validados, com isso foi detectada a presença ou ausência das espécies alvos e com a abordagem de metabarcode foi detectado a presença de outras espécies de peixes, além de outros organismos, presentes nos lagos nos período de seca e cheia. 2020-06-16T12:34:04Z 2020-06-16T12:34:04Z 2020-06-15 Tese https://repositorio.inpa.gov.br/handle/1/19797 http://lattes.cnpq.br/4102952736351817 por CC0 1.0 Universal http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ application/pdf Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA Biologia de Água Doce e Pesca Interior - BADPI
institution Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - Repositório Institucional
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