Dissertação

Desenvolvimento de t?cnica de RT-qPCR para detec??o de hantav?rus amaz?nicos

Resumo: A S?ndrome Pulmonar por Hantav?rus ? uma zoonose emergente, muitas vezes fatal causada por hantav?rus (fam?lia Bunyaviridae). A transmiss?o para humanos ocorre atrav?s do contato com excreta de roedores silvestres infectados. No Brasil, o diagn?stico para hantav?rus ? baseado em t?cnicas...

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Autor principal: Nunes, Bruno Tardelli Diniz
Grau: Dissertação
Idioma: por
Publicado em: Instituto Evandro Chagas 2018
Assuntos:
Acesso em linha: http://patua.iec.gov.br//handle/iec/3108
Resumo:
Resumo: A S?ndrome Pulmonar por Hantav?rus ? uma zoonose emergente, muitas vezes fatal causada por hantav?rus (fam?lia Bunyaviridae). A transmiss?o para humanos ocorre atrav?s do contato com excreta de roedores silvestres infectados. No Brasil, o diagn?stico para hantav?rus ? baseado em t?cnicas imunol?gicas, enquanto que RTPCR ? utilizado como suporte laboratorial. O RT-qPCR tem sido utilizado no diagn?stico molecular de diversos agentes etiol?gicos, principalmente devido ? gera??o r?pida de resultados, junto com elevada sensibilidade e especificidade. No entanto, n?o h? nenhum ensaio de RT-qPCR desenhado para detectar os hantav?rus circulantes na Amaz?nia brasileira. Portanto, este estudo teve como objetivo o desenvolvimento de um ensaio de RT-qPCR controlado internamente para detectar esses hantav?rus. Um conjunto de iniciadores e sonda foi desenhado a partir de uma regi?o do gene N consenso, utilizando sequ?ncias dos hantav?rus VLN, VANAJ, VCAS e VRIOM. Esta mesma regi?o tamb?m foi clonada em plasm?deos e transcrita in vitro para RNA, o qual foi dilu?do em padr?es de concentra??o conhecida. O RNA de bacteri?fago MS2 foi adiconado em todas as amostras antes da extra??o e foi detectado em conjunto com hantav?rus como um controle ex?geno numa reac??o duplex. Para avaliar os valores de sensibilidade, especificidade e acur?cia do protocolo, foram testadas 127 amostras (de sangue ou soro), dividindo-se em tr?s grupos: hantav?rus positivo, hantav?rus negativas e positivas para outros agentes patog?nicos. Os resultados foram comparados aos obtidos por semi-nested RTPCR. A efici?ncia de RT-qPCR ficou em cerca de 100% e o limite de detec??o foi de 0,9 c?pias / mL de RNA. N?o houve amplifica??o de ambos, as amostras negativas ou as amostras positivas de outros agentes patog?nicos. O RT-qPCR foi mais sens?vel do que a semi-nested RT-PCR, sendo capaz de detectar tr?s amostras n?o detectadas pelo semi-nested RT-PCR. A sensibilidade, especificidade e acur?cia RT-qPCR valores foram de 92,5%, 100% e 97,63%, respectivamente. Assim, o ensaio de RT-qPCR desenvolvido foi espec?fico, sens?vel e capaz de gerar resultados em duas horas, o que o torna um poderoso instrumento em aplica??es de diagn?stico, vigil?ncia e investiga??o de hantavirose na regi?o da Amaz?nia brasileira e, possivelmente, para outros hantav?rus