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Dissertação
Sequenciamento completo e caracteriza??o gen?tica dos v?rus MIS 0397 e INHRR 17a-10 (Bunyaviridae, Orthobunyavirus) isolados no Peru e na Venezuela
Resumo: Os v?rus pertencentes ao g?nero Orthobunyavirus , fam?lia Bunyaviridae , s?o agentes virais morfologicamente caracterizados por possu?rem part?culas esf?ricas com tamanho entre 80 e 120 nm de di?metro, envelopadas e por conterem um genoma de RNA trissegmentado, ta simples, polaridade neg...
Autor principal: | Lima, Anderson Franco da Cruz |
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Grau: | Dissertação |
Idioma: | por |
Publicado em: |
Instituto Evandro Chagas
2018
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Assuntos: | |
Acesso em linha: |
http://patua.iec.gov.br//handle/iec/3116 |
Resumo: |
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Resumo: Os v?rus pertencentes ao g?nero Orthobunyavirus , fam?lia Bunyaviridae , s?o
agentes virais morfologicamente caracterizados por possu?rem part?culas esf?ricas
com tamanho entre 80 e 120 nm de di?metro, envelopadas e por conterem um
genoma de RNA trissegmentado, ta simples, polaridade negativa que, em geral
codi ca seis prote?nas, sendo tr?s prote?nas estruturais (N, Gn, Gc) e tr?s prote?nas
n?o estruturais (NSs, NSm, RpRd). Este estudo teve como objetivo realizar a
obten??o do genoma completo de cepas virais isoladas no Peru e Venezuela, os
v?rus MIS 0397 (TVP 19261) e INHRR 17a-10 (TVP 19255), bem como caracterizar
geneticamente os segmentos de RNA (S, M e LRNA), realizar a reconstru??o
logen?tica dos segmentos gen?micos e avaliar a possibilidade de rearranjo
gen?tico em natureza, para estes v?rus. As amostras virais foram isoladas de um
caso febril humano ocorrido em um residente de Lima, Peru, e de um primata n?o
humano ( Cebus sp ) utilizado como sentinela no munic?pio de Azoategui, Venezuela,
respectivamente. As amostras virais foram submetidas a tr?s etapas, i) extra??o do
?cido nucleico (RNA) ; ii) obten??o das sequ?ncias nucleot?dicas por
pirosequenciamento e iii) an?lise computacional. As sequ?ncias completas
evidenciaram tamanhos, organiza??o gen?mica e caracter?sticas gen?ticas (n?mero
de res?duos de ciste?nas, s?tios de glicosila??o, motivos conservados, s?tios de
clivagem, conte?do A-U e complementariedade entre as regi?es 3?-5? n?o
codi cantes) compat?veis com o observado para os membros do g?nero
Orthobunyavirus . As an?lises de similaridade e logenia evidenciaram que os v?rus
MIS 0397 (TVP 19261) e INHRR 17a ? 10 (TVP 19255) s?o geneticamente mais
similares com os membros do grupo Simbu. An?lises evolutivas levando em
considera??o os tr?s segmentos de RNA gen?mico (S, M, L) possuem origens
distintas, sendo os segmentos S e L associados ao VORO e os segmentos MRNA
relacionados aos V?rus Iquitos (VIQT) e V?rus Madre de Dios (VMDD). Por m as
an?lises de troca de segmento gen?mico (Simplot) evidenciaram claramente a
presen?a de eventos de rearranjo entre os v?rus estudados e o VORO con rmando o
processo de rearranjo entre dois v?rus parentais pertencentes ao grupo Simbu. Por
m, os dados de caracteriza??o do genoma completo e an?lise de rearranjo
contribuir?o para melhor entender a contribui??o do processo de rearranjo gen?tico
envolvendo o VORO, um importante pat?geno humano na Amaz?nia. |