Estima-se que existam milh?es de esp?cies de fungos n?o descobertas no mundo, e grande parte dessa biodiversidade est? concentrada em ?reas tropicais, como a Amaz?nia. Nesta regi?o, esp?cies pouco conhecidas de fungos do solo podem abrigar uma vasta variedade de esp?cies de v?rus, conhecidos como micov?rus. Neste estudo, descrevemos tr?s novas esp?cies de micov?rus obtidas do solo da ?rea de Prote??o Ambiental da Ilha do Combu, localizada no estado do Par?, na Amaz?nia brasileira. Amostras de solo foram coletadas em cinco pontos ao longo de trilhas florestais. Cada amostra foi posteriormente inoculada em placas de Petri contendo ?gar batata dextrose para diferencia??o entre col?nias morfologicamente distintas e isolamento f?ngico. O RNA total dos isolados foi extra?do e sequenciado usando o Illumina HiSeq 2500. As leituras foram montadas pelo m?todo de novo, e os contigs gerados foram comparados usando Blastx. Os genes ribossomais foram preditos e utilizados para identifica??o dos fungos usando a regi?o ITS. Os micov?rus foram comparados com outros v?rus similares dispon?veis no banco de dados NCBI atrav?s de infer?ncias filogen?ticas de m?xima verossimilhan?a baseadas no gene da polimerase. Dos nove fungos isolados, dois continham micov?rus. Um micov?rus de dsRNA e um de ssRNA positivo, ambos identificados no Simplicillium sympodiophorum, indicando uma coinfec??o. Um micov?rus de ssRNA negativo tamb?m foi detectado em Mucor irregularis. Estes tr?s v?rus s?o esp?cies novas, e para eles sugerimos os nomes Combu double-strand RNA mycovirus (CDRV), Combu positive-strand RNA mycovirus (CPRV) e Combu negative-strand RNA mycovirus (CNRV). Esses novos v?rus s?o filogeneticamente pr?ximos dos v?rus da fam?lia Amalgaviridae, no g?nero Ourmiavirus e da ordem Bunyavirales, respectivamente. Nossas an?lises mostram a necessidade urgente de um m?todo expandido de organiza??o taxon?mica para esses novos micov?rus e outros micov?rus ainda n?o classificados relatados na literatura.
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