Predição de estrutura de proteína por homologia assistida por ontologia.
Predição de estrutura de proteína é um processo na Biologia Molecular pelo qual a estrutura 3D de uma proteína é determinada com base em estruturas já conhecidas de outras proteínas. É um processo importante porque a estrutura de uma proteína é um fator determinante para sua função na célula. Conhe...
| Autor principal: | Pinagé, Kellen Fabiane da Silva |
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| Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/6127552144687091 |
| Grau: | Dissertação |
| Idioma: | por |
| Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2015
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| Assuntos: | |
| Acesso em linha: |
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/2888 |
| Resumo: |
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Predição de estrutura de proteína é um processo na Biologia Molecular pelo qual a estrutura 3D de uma proteína é determinada com base em estruturas já conhecidas
de outras proteínas. É um processo importante porque a estrutura de uma proteína é um fator determinante para sua função na célula. Conhecendo a estrutura de uma
proteína, os cientistas podem descobrir que tipo de atividade a proteína realiza na célula e criar drogas para combater doenças. O processo de predição é baseado na similaridade entre as seqüências de aminoácidos que formam proteínas: a estrutura de uma proteína alvo é predita reusando conhecimento de proteínas cujas estruturas já foram determinadas e suas seqüências de aminoácidos são similares à seqüência alvo. Portanto, reuso de conhecimento ocorre no processo de predição de estrutura de proteína, mas sem a utilização de uma ontologia de domínio. Neste trabalho, nós
aplicamos uma técnica de reuso de conhecimento baseado em ontologia na predição de estrutura de proteína com o objetivo de melhorar o processo de predição em sua eficiência e qualidade das estruturas obtidas. Um experimento foi realizado no qual a técnica foi aplicada para predizer a estrutura de 286 seqüências alvo. Houve melhorias e perdas de qualidade das estruturas preditas, ao passo que um ganho de performance (tempo de execução) foi observado em 38% das seqüências alvo. |