Análise da diversidade bacteriana dos Rios Negro e Solimões pela abordagem metagenômica
Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e...
| Autor principal: | Peixoto, Jean Charles da Cunha |
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| Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/6421264538330799 |
| Grau: | Tese |
| Idioma: | por |
| Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2015
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| Assuntos: | |
| Acesso em linha: |
http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/4707 |
| Resumo: |
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Este estudo comparou a estrutura dc comunidades bacterianas dos rios Solimoes e
Negro, baseada na anélise do gene rRNA 168. 0 DNA total foi extraido depois da filtraeio da
égua através dos filtros de 0.8pM e 0.22uM, respectivamente. 0 gene rRNA 168 foi
amplificado por PCR. clonado e seqiienciado. e as seqiiéncias foram analisadas pelos
programas PHYLIP e DOTUR para obtengio das OTUs. e célculo dos indices de diversidade
e riqueza pelo programa SPADE. A afiliaqio taxonémica foi feita pela submissfio das
seqfiéncias aos programas BLASTn e naive Bayesian rRNA Classifier do RDP II (Ribosomal
Database Project). A érvore filogenética foi construfda pelo método Neighbor Joining pelo
programa Mega, versfio 4. 0s resultados mostraram uma vasta riqueza de 01' Us bacterianas,
nos dois ambientes. O rio Solimées apresentou maior diversidade de géneros bacterianos.
enquanto na biblioteca do do Negro, embora menos diverso, foi encontrada uma maior
concentraqio de OTUs penencentes a um género bacteriano especffico, Polynucleobacter,
acenando para uma investigaqio mais incisiva no intuito de se entender o papel desempenhado por essas bactérias nesses ambientes ainda pouco explorados. |