As gastrenterites humanas estão entre as doenças de maior impacto na saúde pública
ao nível mundial. São diversos os agentes etiológicos causadores da diarreia, merecendo
destaque o rotavírus, patógeno viral proeminente na gênese de gastrenterite aguda grave na
infância, sendo responsável por mais de 200 mil mortes de crianças em todo o mundo. O
rotavírus é constituído por um genoma de 11 segmentos de RNA dupla fita que codificam 6
proteínas estruturais (VPs) e 6 proteínas não-estruturais (NSPs). A atual classificação dos
rotavírus tem base na caracterização gênica dos 11 segmentos virais para a identificação de
seus respectivos genótipos, designados em conjunto como genótipos de constelação. A
vigilância epidemiológica que inclui a caracterização molecular é uma importante
ferramenta para o estudo da dinâmica de variações das cepas diante de fatores evolutivos
como a implementação da vacina Rotarix (GlaxoSmithKline), introduzida no Brasil desde
2006. A finalidade deste estudo foi realizar análises epidemiológicas, detecção e
caracterização de genes de rotavírus que infectaram crianças com até 10 anos de idade,
atendidas em hospitais públicos de Manaus entre os anos de 2007 e 2008. Foram coletadas
1337 amostras diarreicas. Observou-se um percentual de 5,4 % de positividade para
rotavírus. Foram identificados os genótipos virais através das reações em cadeia pela
polimerase precedida da transcrição reversa. O genótipo G2P[4] foi encontrado em 93% dos
casos, seguido do G[NT-não tipado]P4 em 6% e G2P[9] em 1% das amostras. Dentre as 73
amostras detectadas nesta pesquisa, 58 eram elegíveis à atual vacina. As análises
filogenéticas revelaram um padrão de agrupamento das sequências gênicas em clusters que
apresentaram similaridade com amostras provenientes de Belém (Brasil) e da China.
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