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Dissertação
Detecção e caracterização gênica de rotavírus de pacientes atendidos em hospitais públicos infantis da cidade de Manaus, Amazonas, entre os anos de 2007 e 2008
As gastrenterites humanas estão entre as doenças de maior impacto na saúde pública ao nível mundial. São diversos os agentes etiológicos causadores da diarreia, merecendo destaque o rotavírus, patógeno viral proeminente na gênese de gastrenterite aguda grave na infância, sendo responsável por mai...
Autor principal: | Balieiro, Karen Campos |
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Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/7933563181682161 |
Grau: | Dissertação |
Idioma: | por |
Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2017
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Assuntos: | |
Acesso em linha: |
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oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-60742019-11-14T15:01:06Z Detecção e caracterização gênica de rotavírus de pacientes atendidos em hospitais públicos infantis da cidade de Manaus, Amazonas, entre os anos de 2007 e 2008 Balieiro, Karen Campos Orlandi, Patrícia Puccinelli http://lattes.cnpq.br/7933563181682161 http://lattes.cnpq.br/1887686774621627 Doença Diarreica Rotavírus Epidemiologia Caracterização Molecular CIÊNCIAS DA SAÚDE As gastrenterites humanas estão entre as doenças de maior impacto na saúde pública ao nível mundial. São diversos os agentes etiológicos causadores da diarreia, merecendo destaque o rotavírus, patógeno viral proeminente na gênese de gastrenterite aguda grave na infância, sendo responsável por mais de 200 mil mortes de crianças em todo o mundo. O rotavírus é constituído por um genoma de 11 segmentos de RNA dupla fita que codificam 6 proteínas estruturais (VPs) e 6 proteínas não-estruturais (NSPs). A atual classificação dos rotavírus tem base na caracterização gênica dos 11 segmentos virais para a identificação de seus respectivos genótipos, designados em conjunto como genótipos de constelação. A vigilância epidemiológica que inclui a caracterização molecular é uma importante ferramenta para o estudo da dinâmica de variações das cepas diante de fatores evolutivos como a implementação da vacina Rotarix (GlaxoSmithKline), introduzida no Brasil desde 2006. A finalidade deste estudo foi realizar análises epidemiológicas, detecção e caracterização de genes de rotavírus que infectaram crianças com até 10 anos de idade, atendidas em hospitais públicos de Manaus entre os anos de 2007 e 2008. Foram coletadas 1337 amostras diarreicas. Observou-se um percentual de 5,4 % de positividade para rotavírus. Foram identificados os genótipos virais através das reações em cadeia pela polimerase precedida da transcrição reversa. O genótipo G2P[4] foi encontrado em 93% dos casos, seguido do G[NT-não tipado]P4 em 6% e G2P[9] em 1% das amostras. Dentre as 73 amostras detectadas nesta pesquisa, 58 eram elegíveis à atual vacina. As análises filogenéticas revelaram um padrão de agrupamento das sequências gênicas em clusters que apresentaram similaridade com amostras provenientes de Belém (Brasil) e da China. The human gastroenteritis are among the diseases of greatest public health impact worldwide. There are several etiologic agents of diarrhea, with emphasis rotavirus, viral pathogen prominently in the genesis of severe acute gastroenteritis in childhood, accounting for over 450,000 deaths in children worldwide. The rotavirus genome consists of a 11 segment of double stranded RNA encoding six structural proteins (VPs) and five nonstructural proteins (NSPs). Classification of rotavirus serotypes and genotypes is based on the epitopes of the glycoprotein VP7 neutralized, called G, and VP4 protease-sensitive protein called P, which generates a binary classification scheme G and P. Epidemiological studies of molecular characterization of genes encoding for proteins of rotavirus are essential for assessing the effectiveness of the vaccine Rotarix (GlaxoSmithKline), introduced in Brazil since 2006, in addition to assessing the possible emergence of new viral genotypes. The aim of this study was to identify and characterize genes of rotavirus in feces of children with diarrhea in Manaus between the years 2007 and 2008. 1337 samples were collected from diarrheal children under 10 years old in the city of Manaus, between the years 2007 and 2008. There was a percentage of 5.4% of positive samples for rotavirus. Viral genotypes were identified through polymerase chain reactions preceded by reverse transcription. The genotype G2P[4] was found in 93% of cases, followed by G [NT-untyped] P4 in 6% and G2P[9] 1% of the samples. Among the 73 samples detected in this study, 58 were eligible for the current vaccine. Phylogenetic analysis revealed a pattern of clustering of gene sequences into clusters that showed similarity with samples from Belém (Brazil) and China. CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior 2017-12-22T19:23:42Z 2013-09-30 Dissertação BALIEIRO, Karen Campos. Detecção e caracterização gênica de rotavírus de pacientes atendidos em hospitais públicos infantis da cidade de Manaus, Amazonas, entre os anos de 2007 e 2008. 2013. 100 f. Dissertação (Mestrado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2013. http://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6074 por Acesso Aberto http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ application/pdf Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada |
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TEDE - Universidade Federal do Amazonas |
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As gastrenterites humanas estão entre as doenças de maior impacto na saúde pública
ao nível mundial. São diversos os agentes etiológicos causadores da diarreia, merecendo
destaque o rotavírus, patógeno viral proeminente na gênese de gastrenterite aguda grave na
infância, sendo responsável por mais de 200 mil mortes de crianças em todo o mundo. O
rotavírus é constituído por um genoma de 11 segmentos de RNA dupla fita que codificam 6
proteínas estruturais (VPs) e 6 proteínas não-estruturais (NSPs). A atual classificação dos
rotavírus tem base na caracterização gênica dos 11 segmentos virais para a identificação de
seus respectivos genótipos, designados em conjunto como genótipos de constelação. A
vigilância epidemiológica que inclui a caracterização molecular é uma importante
ferramenta para o estudo da dinâmica de variações das cepas diante de fatores evolutivos
como a implementação da vacina Rotarix (GlaxoSmithKline), introduzida no Brasil desde
2006. A finalidade deste estudo foi realizar análises epidemiológicas, detecção e
caracterização de genes de rotavírus que infectaram crianças com até 10 anos de idade,
atendidas em hospitais públicos de Manaus entre os anos de 2007 e 2008. Foram coletadas
1337 amostras diarreicas. Observou-se um percentual de 5,4 % de positividade para
rotavírus. Foram identificados os genótipos virais através das reações em cadeia pela
polimerase precedida da transcrição reversa. O genótipo G2P[4] foi encontrado em 93% dos
casos, seguido do G[NT-não tipado]P4 em 6% e G2P[9] em 1% das amostras. Dentre as 73
amostras detectadas nesta pesquisa, 58 eram elegíveis à atual vacina. As análises
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