Tese

Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica

A biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar de possuírem o potencial...

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Autor principal: Castro, Diogo Pereira de
Outros Autores: http://lattes.cnpq.br/5143585130152199
Grau: Tese
Idioma: por
Publicado em: Universidade Federal do Amazonas 2018
Assuntos:
Petróleo
Biorremediação
Degradação de Hidrocarbonetos
Proteômica
CIENCIAS BIOLOGICAS
Acesso em linha: https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260
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spelling oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-62602018-03-22T05:03:36Z Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica Castro, Diogo Pereira de Orlandi, Patrícia Puccinelli http://lattes.cnpq.br/5143585130152199 http://lattes.cnpq.br/1887686774621627 Batista, Ieda Hortêncio Teixeira, Ana Frazão Chapeaurouge, Donat Alexander de Petróleo Biorremediação Degradação de Hidrocarbonetos Proteômica CIENCIAS BIOLOGICAS A biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar de possuírem o potencial de degradação de petróleo, a aplicação de bactérias em ambientes contaminados pode interferir em seu equilíbrio ecológico. Este estudo propôs-se a seleção de uma linhagem bacteriana para promover estudos de caracterização gênica, identificação do potencial de degradação de hidrocarbonetos e definição das proteínas envolvidas no processo de degradação. Para alcançar os objetivos, foram identificadas substâncias degradadas por cromatografia gasosa e proteínas envolvidas por proteômica; A análise do genoma permitiu a caracterização dos genes relacionados a degradação de compostos xenobióticos através da revisão da literatura. A cepa foi identificada como Pseudomonas putida S16. Foram detectadas 51 substâncias por cromatografia gasosa, destas, 23 foram completamente degradadas, incluindo HPAs contendo naftaleno (100%), antraceno (11,49%) e fenantreno (7,41%). Foram identificados 89 genes relacionados a degradação de xenobíoticos no genoma da P. putida S16 AM, genes capazes de degradar naftaleno, antraceno e fenantreno (nah, phn, fdx, catA), produção de citocromo e quimiotaxia. Na análise proteômica, foram expressas proteínas de óxido-redução, processos metabólicos, poliaminas, aldeído desidrogenase, armazenamento de carbono, quimiotaxia e síntese de aminoácidos. Foram identificadas 355 proteínas com redundância expressas durante o contato de 7h da P. putida S16 AM (I4) com o petróleo, e 268 no contato de 75h; Para o glicerol, foram identificadas 467 na interação de 7h, e 228 no contato de 75h. A presença de proteínas relacionadas ao metabolismo e óxidoredução quando a cepa em estudo esteve em contato com o petróleo evidenciam a utilização deste como fonte de carbono para o metabolismo bacteriano. Estes estudos são importantes devido à identificação de genes e proteínas que possuem o potencial de se tornarem produtos biotecnológicos de aplicação prática. Bioremediation is the use of microorganisms capable of metabolizing contaminants and converts them into less toxic products. In previous studies, we performed bacteria isolation from contaminated area for oil waste in Amazon. Despite its oil degradation potential, the application of bacteria in contaminated sites may interfere with their ecological balance. This study aimed to promote studies of gene characterization and hydrocarbon degradation potential with a selected bacterial strain and identify and define the proteins involved in degradation process. To achieve this objectives degraded substances have been identified by gas chromatography and proteins involved by proteomics; Genome analysis allowed characterization of genes related to xenobiotics degradation. The strain was identified as Pseudomonas putida S16. 51 substances were detected by gas chromatography, of these, 23 were completely degraded, including PAH containing naphthalene (100%), anthracene (11.49%) and phenanthrene (7.41%). We identified 89 genes related to xenobiotic degradation in P. putida S16 AM genome, genes capable of degrading naphthalene, anthracene and phenanthrene (nah, phn, fdx, catA), cytochrome production and chemotaxis. In proteome analysis, proteins were expressed oxidation-reduction, metabolic processes, polyamines, aldehyde dehydrogenase, carbon storage, chemotaxis and amino acid synthesis. 355 proteins were identified with redundancy expressed during 7h contact to P. putida S16 AM (I4) with petroleum, and 268 during 75h contact; For glycerol, 467 were identified in 7h interaction, and 228 in 75h contact. The presence of proteins related to metabolism and oxidationreduction when the strain under study was in contact to the petroleum suggest the use of this as a carbon source for bacterial metabolism. These studies are important because of identification of genes and proteins with potential to become practical application of biotechnology products. FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas 2018-03-21T14:52:21Z 2015-11-30 Tese CASTRO, Diogo Pereira de. Caracterização do potencial de degradação de um isolado bacteriano oriundo da região Amazônica. 2015. 154 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2015. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6260 por Acesso Aberto http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ application/pdf Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia
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