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Tese
Transcriptoma de Copaifera multijuga Hayne: montagem e anotação
Copaifera multijuga Hayne é uma espécie de planta de grande porte, popularmente conhecida como copaíba, nativa da América Latina e da África. São amplamente utilizadas na medicina popular amazônica, devido as propriedades do óleo-resina extraído do tronco de suas árvores, utilizado principalment...
Autor principal: | Santos, Eliane Carvalho dos |
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Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/4519145725946392 |
Grau: | Tese |
Idioma: | por |
Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2018
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Assuntos: | |
Acesso em linha: |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/6728 |
Resumo: |
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Copaifera multijuga Hayne é uma espécie de planta de grande porte,
popularmente conhecida como copaíba, nativa da América Latina e da África.
São amplamente utilizadas na medicina popular amazônica, devido as
propriedades do óleo-resina extraído do tronco de suas árvores, utilizado
principalmente como: diurético, laxativo, antitetânico, anti-inflamatório,
antitussígeno, cicatrizante e anti-tumoral. Sendo, portanto, de grande
importância para pesquisas que visem identificar nas plantas substâncias com
potenciais finalidades médicas e biotecnológicas. Por isto, este trabalho visou
pesquisar o transcriptoma de C. multijuga Hayne, o qual foi sequênciado
utilizando a plataforma 454 Roche, sendo obtido um total de 638.576 reads,
montados através da metodologia de novo com auxílio das plataformas MIRA e
TRINITY. Sendo gerados, a partir da montagem por TRINITY 53.319 contigs e
62.839 pela montagem MIRA. A anotação do transcriptoma foi realizada
utilizando BLASTx (NCBI) e a anotação funcional através do banco Gene
Ontology (GO). Os resultados obtidos foram categorizados de acordo com GO,
onde os unigenes foram agrupados nas categorias: “Componente Celular” com
6.249 contigs envolvidos nesta categoria, “Função Molecular” com total 17.208
contigs e “Processo Biológico” com 9.499 contigs. Nas três categorias os
contigs evidenciados estão envolvidos no metabolismo primário vegetal. Já do
metabolismo secundário foram detectados 184 unigenes, sendo organizados
em 22 clusters, envolvidos principalmente em respostas ao estresse oxidativo
vegetal, compostos terpenos, importantes metabólitos envolvidos na formação
do óleo-resina de copaíba, diterpenos (porção resinosa do óleo-resina) e
sesquiterpenos (componentes voláteis do óleo) e unigenes relacionados com a
pigmentação vegetal tais como: flavonóides, carotenóides e antocianinas. Na
análise filogenética foram feitas comparações evolutivas de enzimas de
terpenos sintases, componentes de formação do óleo de copaíba, com
enzimas do banco de dados NCBI. O unigene de TPS4-2 de C. multijuga
mostrou-se mais próximo a outras sequências de terpenos TPS4-2 de
Copaifera disponíveis no banco. Com isto, neste trabalho realizou-se o
transcriptoma de C. multijuga com a montagem de novo e anotação o que leva
a perspectiva de estudos com os unigenes codificadores de enzimas
componentes do óleo-resina evidenciados neste trabalho, visando com isto
futuras pesquisas para fins biotecnológicos. |