Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas
A região Neotropical é a mais biodiversa do mundo e os fatores que influenciaram a origem de uma diversidade tão alta são fontes inesgotáveis de pesquisas. Entre os vertebrados terrestres, os anfíbios configuram como um dos grupos mais diversos, e 43% de todas as espécies conhecidas ocorrem nos N...
| Autor principal: | Almeida, Alexandre Pinheiro de |
|---|---|
| Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/9328491356236957, https://orcid.org/0000-0003-3938-4198 |
| Grau: | Tese |
| Idioma: | por |
| Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia
2023
|
| Assuntos: | |
| Acesso em linha: |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9833 |
| id |
oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-9833 |
|---|---|
| recordtype |
dspace |
| spelling |
oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-98332023-11-24T05:03:49Z Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas Almeida, Alexandre Pinheiro de Gordo, Marcelo http://lattes.cnpq.br/9328491356236957 http://lattes.cnpq.br/7974425330619510 Silva Junior, Miquéias Ferrão da Strussmann, Christine Fraga, Rafael de https://orcid.org/0000-0003-3938-4198 Filogenia - Pesquisa CIENCIAS BIOLOGICAS: ZOOLOGIA Espécies crípticas Filogeografia 16S rDNA Single Nucleotide Polimorphism (SNPs) Cophomantini Neotrópico Filogenia A região Neotropical é a mais biodiversa do mundo e os fatores que influenciaram a origem de uma diversidade tão alta são fontes inesgotáveis de pesquisas. Entre os vertebrados terrestres, os anfíbios configuram como um dos grupos mais diversos, e 43% de todas as espécies conhecidas ocorrem nos Neotrópicos. Apesar disso ainda persistem muitas lacunas de conhecimento acerca da riqueza de espécie em função dos altos níveis de diversidade críptica e extensas regiões geográficas desconhecidas. No entanto, o uso de dados moleculares em abordagens de taxonomia integrativa associando métodos de delimitação entre espécies e dados fenotípicos ajudam a esclarecer os limites de distribuição das espécies, ampliando o debate acerca da dos padrões de diversificação, taxonomia e história evolutiva dos anuros neotropicais. O grupo Boana punctata agrega vários destes gargalos de conhecimento; sejam esses relacionados a sistemática do grupo, filogenia e taxonomia; como também sobre os padrões de diversidade críptica em espécies bem conhecidas e de ampla distribuição, como os complexos Boana cinerascens e Boana punctata. Assim, a ausência de conhecimento refinado acerca das relações filogenéticas das espécies pouco conhecidas do grupo B. punctata, e a falta de esclarecimento filogenético e taxonômico no complexo B. punctata foram objeto de estudo nesta tese que teve como resultados: Cap 1- Com base em sequências de DNA mitocondrial e dados morfológicos, fornecemos novas informações sobre as relações filogenéticas, variações morfológicas e distribuição geográfica. Dentre os principais resultados revelamos que B. hobbsi está relacionado com o grupo Boana benitezi, polifilético à B. punctata. Apoiado nisso, propomos um novo arranjo taxonômico que inclui B. hobbsi como membro do grupo B. benitezi; Cap 2- Utilizando sequências do gene 16S rDNA do complexo B. punctata e métodos de delimitação de espécies em uma abordagem de taxonomia integrativa, descobrimos seis linhagens correspondentes a unidades taxonômicas operacionais (OTUs). Entre elas, uma espécie candidata não confirmada, cinco espécies candidatas confirmadas das quais duas correspondem a táxons reconhecidos: dessa forma delimitamos B. punctata Senso Strictu, Boana atlantica, e elevamos Boana rubrolineata ao status de espécie plena. Cap- 3 Com dados genômicos obtidos por sequenciamento de próxima geração (NGS) e análises de descobrimento de espécies, conseguimos delimitar espécies putativas e realizar uma análise de datação molecular. Os resultados revelaram uma diversidade críptica maior do que a encontrada no capítulo anterior desse estudo com sete espécies candidatas confirmadas pelos dados genéticos e morfológicos. Destas, três representam B. punctata, B. atlantica e B. rubrolinetata e quatro candidatas a espécies. As análises de datação molecular mostram uma diversificação do complexo B. punctata que iniciou no Mioceno tardio seguido por eventos subsequentes ao longo do Plioceno e Pleistoceno. The Neotropical region is the most biodiverse in the world, and the factors that influenced the origin of such a high diversity are inexhaustible sources of research. Among the terrestrial vertebrates, amphibians are one of the most diverse groups, and 43% of all known species occur in the Neotropics. However, there are still many knowledge gaps regarding species richness due to high levels of cryptic diversity and large unknown geographic regions. However, the use of molecular data in integrative taxonomy approaches associating species delimitation methods and phenotypic data helps to clarify the limits of species distribution, broadening the debate about patterns of diversification, taxonomy and evolutionary history of Neotropical anurans. The Boana punctata group has several of these knowledge shortfalls; whether related to group systematics, phylogeny and taxonomy, or to patterns of cryptic diversity in well-known species with wide distribution, such as the Boana cinerascens and Boana punctata complexes and their taxonomic issues. Thus, the lack of refined knowledge about the phylogenetic relationships of these poorly known species of the Boana punctata group, and the lack of phylogenetic and taxonomic clarification in the B. punctata complex are object of study in this thesis that had as results: Cap 1- Based on mitochondrial DNA sequences, morphological data, we provide new information on phylogenetic relationships, morphological variations and geographical distribution. Such results reveal that B. hobbsi is related to the Boana benitezi group, polyphyletic to B. punctata. Supported by this, we propose a new taxonomic arrangement that includes B. hobbsi as a member of the B. benitezi group; Cap 2- Using 16S rDNA gene sequences from the B. punctata and species delimitation methods in an integrative taxonomy approach, we discovered six well supported lineages delimited as operational taxonomic unities (OTUs). Which consists in, one unconfirmed candidate species, five confirmed candidate species of which two correspond to recognized taxa: thus, we delimit B. punctata Senso Strictu, Boana atlantica, and elevate Boana rubrolineata to full species status. Cap 3- With genomic data obtained by next- generation sequencing (NGS) and discovery analyses we were able to delimit putative species and perform a molecular dating analysis, revealing a higher cryptic diversity, than observed in our Cap. 2 study. Our results confirmed seven candidate species co by genetic and morphological data. Of these, three represent the nominal taxa B. punctata, B. atlantica and B. rubrolinetata; and the remaining lineages correspond to four candidate species. Molecular dating analyses show a diversification of the B. punctata complex beginning in the late Miocene followed by subsequent events throughout the Pliocene and Pleistocene. FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas 2023-11-23T16:03:52Z 2999-12-31 2022-05-31 Tese ALMEIDA, Alexandre Pinheiro de. Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas. 2022. 184 f. Tese (Doutorado em Zoologia) - Universidade Federal do Amazonas - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Manaus (AM), 2023. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9833 por Acesso Embargado https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ application/pdf Universidade Federal do Amazonas - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM - INPA Programa de Pós-graduação em Zoologia |
| institution |
TEDE - Universidade Federal do Amazonas |
| collection |
TEDE-UFAM |
| language |
por |
| topic |
Filogenia - Pesquisa CIENCIAS BIOLOGICAS: ZOOLOGIA Espécies crípticas Filogeografia 16S rDNA Single Nucleotide Polimorphism (SNPs) Cophomantini Neotrópico Filogenia |
| spellingShingle |
Filogenia - Pesquisa CIENCIAS BIOLOGICAS: ZOOLOGIA Espécies crípticas Filogeografia 16S rDNA Single Nucleotide Polimorphism (SNPs) Cophomantini Neotrópico Filogenia Almeida, Alexandre Pinheiro de Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| topic_facet |
Filogenia - Pesquisa CIENCIAS BIOLOGICAS: ZOOLOGIA Espécies crípticas Filogeografia 16S rDNA Single Nucleotide Polimorphism (SNPs) Cophomantini Neotrópico Filogenia |
| description |
A região Neotropical é a mais biodiversa do mundo e os fatores que influenciaram a origem
de uma diversidade tão alta são fontes inesgotáveis de pesquisas. Entre os vertebrados
terrestres, os anfíbios configuram como um dos grupos mais diversos, e 43% de todas as
espécies conhecidas ocorrem nos Neotrópicos. Apesar disso ainda persistem muitas lacunas
de conhecimento acerca da riqueza de espécie em função dos altos níveis de diversidade
críptica e extensas regiões geográficas desconhecidas. No entanto, o uso de dados moleculares
em abordagens de taxonomia integrativa associando métodos de delimitação entre espécies e
dados fenotípicos ajudam a esclarecer os limites de distribuição das espécies, ampliando o
debate acerca da dos padrões de diversificação, taxonomia e história evolutiva dos anuros
neotropicais.
O grupo Boana punctata agrega vários destes gargalos de conhecimento; sejam esses
relacionados a sistemática do grupo, filogenia e taxonomia; como também sobre os padrões
de diversidade críptica em espécies bem conhecidas e de ampla distribuição, como os
complexos Boana cinerascens e Boana punctata. Assim, a ausência de conhecimento refinado
acerca das relações filogenéticas das espécies pouco conhecidas do grupo B. punctata, e a
falta de esclarecimento filogenético e taxonômico no complexo B. punctata foram objeto de
estudo nesta tese que teve como resultados: Cap 1- Com base em sequências de DNA
mitocondrial e dados morfológicos, fornecemos novas informações sobre as relações
filogenéticas, variações morfológicas e distribuição geográfica. Dentre os principais
resultados revelamos que B. hobbsi está relacionado com o grupo Boana benitezi, polifilético
à B. punctata. Apoiado nisso, propomos um novo arranjo taxonômico que inclui B. hobbsi
como membro do grupo B. benitezi; Cap 2- Utilizando sequências do gene 16S rDNA do
complexo B. punctata e métodos de delimitação de espécies em uma abordagem de
taxonomia integrativa, descobrimos seis linhagens correspondentes a unidades taxonômicas
operacionais (OTUs). Entre elas, uma espécie candidata não confirmada, cinco espécies
candidatas confirmadas das quais duas correspondem a táxons reconhecidos: dessa forma
delimitamos B. punctata Senso Strictu, Boana atlantica, e elevamos Boana rubrolineata ao
status de espécie plena. Cap- 3 Com dados genômicos obtidos por sequenciamento de
próxima geração (NGS) e análises de descobrimento de espécies, conseguimos delimitar
espécies putativas e realizar uma análise de datação molecular. Os resultados revelaram uma
diversidade críptica maior do que a encontrada no capítulo anterior desse estudo com sete espécies candidatas confirmadas pelos dados genéticos e morfológicos. Destas, três
representam B. punctata, B. atlantica e B. rubrolinetata e quatro candidatas a espécies. As
análises de datação molecular mostram uma diversificação do complexo B. punctata que
iniciou no Mioceno tardio seguido por eventos subsequentes ao longo do Plioceno e
Pleistoceno. |
| author_additional |
Gordo, Marcelo |
| author_additionalStr |
Gordo, Marcelo |
| format |
Tese |
| author |
Almeida, Alexandre Pinheiro de |
| author2 |
http://lattes.cnpq.br/9328491356236957 https://orcid.org/0000-0003-3938-4198 |
| author2Str |
http://lattes.cnpq.br/9328491356236957 https://orcid.org/0000-0003-3938-4198 |
| title |
Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| title_short |
Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| title_full |
Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| title_fullStr |
Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| title_full_unstemmed |
Sistemática e padrões de diversidade do grupo Boana punctata (Anura: Hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| title_sort |
sistemática e padrões de diversidade do grupo boana punctata (anura: hylidae): história evolutiva e implicações taxonômicas |
| publisher |
Universidade Federal do Amazonas - Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia |
| publishDate |
2023 |
| url |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9833 |
| _version_ |
1831970264601067520 |
| score |
11.753896 |