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Filogeografia Scoloplax dolicholophia Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes, Loricarioidea, Scoloplacidae)

Este trabalho apresenta diferentes tipos de abordagens filogenéticas, com fins de analisar a filogeografia da espécie Scoloplax dolicholophia, possibilitando responder a hipóteses de distribuição desse grupo, uma vez que esta espécie faz parte de praticamente toda a extensão do Rio Negro, desde São...

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Autor principal: Melo, Welton Luiz Gato
Grau: tcc
Idioma: por
Publicado em: Universidade do Estado do Amazonas 2019
Assuntos:
Genética de populações
Loricarioidea
Scoloplax dolicholophia
Acesso em linha: http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/1454
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spelling oai:repositorioinstitucional:riuea-14542019-05-10T19:36:29Z Filogeografia Scoloplax dolicholophia Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes, Loricarioidea, Scoloplacidae) Phylogeography Scoloplax dolicholophia Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes, Loricarioidea, Scoloplacidae) Melo, Welton Luiz Gato Genética de populações Loricarioidea Scoloplax dolicholophia Este trabalho apresenta diferentes tipos de abordagens filogenéticas, com fins de analisar a filogeografia da espécie Scoloplax dolicholophia, possibilitando responder a hipóteses de distribuição desse grupo, uma vez que esta espécie faz parte de praticamente toda a extensão do Rio Negro, desde São Gabriel da Cachoeira até a foz próximo ao município de Manaus. Foram utilizadas 8 amostras sendo, 1 de São Gabriel da Cachoeira, 2 coletadas no Rio Jufari (Médio Rio Negro), 2 amostras do Rio Tarumã e 3 amostras do município de Iranduba. Os DNAs dessas amostras foram extraídas e sequenciadas (região Citocromo Oxidase I e 16s) no Laboratório Temático de Biologia Molecular no INPA. Essas amostras posteriormente foram analisadas pelos modelos General Time Reversible Model, Gamma Distributed através do software MEGA, para a análise filogenética e Bootstrap 5000 repetições, no mesmo software. Para a distância genética foi utilizado o método P, que resultou em uma maior divergência de 0,0026 para o grupo do Rio Jufari e para o grupo de coletado em Iranduba, e menor divergência para o Grupo de São Gabriel da Cachoeira e Rio Jufari com o valor de 0.0014. Para o número de haplótipos temos 5 regiões que foram acusadas pelo programa DNASP, e configuradas como uma rede de haplótipos no software NETWORK, revelando ligação entre os grupos do Rio Negro, porém, apontam para um isolamento dos exemplares do Município de Iranduba. This work presents different types of phylogenetic approaches, with the purpose of analyzing the phylogeography of the species Scoloplax dolicholophia, allowing to answer the hypotheses of distribution of this group, since this species is part of almost all the extension of the Black River, from São Gabriel da Cachoeira until the mouth near the municipality of Manaus. Eight samples were used, one from São Gabriel da Cachoeira, two from Rio Jufari (Rio Negro Middle), two samples from the Tarumã River and three samples from the municipality of Iranduba. The DNAs from these samples were extracted and sequenced (Cytochrome Oxidase I and 16s region) at the Thematic Laboratory of Molecular Biology at INPA. These samples were later analyzed by the General Time Reversible Model, Gamma Distributed through the MEGA software, for phylogenetic analysis and Bootstrap 5000 replications, in the same software. For the genetic distance, the P method was used, which resulted in a greater divergence of 0.0026 for the Jufari River group and for the group collected in Iranduba, and less divergence for the Group of São Gabriel da Cachoeira and Rio Jufari with the value of 0.0014. For the number of haplotypes we have 5 regions that were accused by the DNASP program, and configured as a network of haplotypes in the NETWORK software, revealing a link between the groups of Rio Negro, but point to an isolation of the Iranduba Municipality. 2019-02-19T13:16:50Z 2017-12-11 2019-02-19T13:16:50Z tcc MELO, Welton Luiz Gato. Filogeografia Scoloplax dolicholophia Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes, Loricarioidea, Scoloplacidae). Manaus: Universidade do Estado do Amazonas, 2017. http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/1454 por Atribuição-NãoComercial-SemDerivados 3.0 Brasil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ application/pdf Universidade do Estado do Amazonas
institution Repositório Institucional - Universidade do Estado do Amazonas - UEA
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