Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas

Martins, Valquíria do Carmo Alves; http://lattes.cnpq.br/5355326097001242; https://orcid.org/0000-0003-1259-9738

Tese

Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas

O Câncer de pênis apresenta alta incidência no Brasil, sobretudo nas regiões Norte e Nordeste. De etiologia heterogênea, pode estar relacionado à infecção pelo HPV ou por outros mecanismos moleculares. Neste estudo, A infecção pelo HPV foi observada em 45% dos casos. A infecção pelo EBV foi 30% e 25...

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Autor principal:	Martins, Valquíria do Carmo Alves
Outros Autores:	http://lattes.cnpq.br/5355326097001242, https://orcid.org/0000-0003-1259-9738
Grau:	Tese
Idioma:	por
Publicado em:	Universidade Federal do Amazonas 2020
Assuntos:	Epidemiologia - Pesquisa Neoplasia peniana Pesquisa sociodemográfica Papilomavírus Vírus Epstein-Barr CIÊNCIAS DA SAÚDE Câncer de pênis Epidemiologia Viroma Metagenoma Amazonas
Acesso em linha:	https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989

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spelling	oai:https:--tede.ufam.edu.br-handle-:tede-79892020-10-31T05:03:48Z Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas Martins, Valquíria do Carmo Alves Silva, Kátia Luz Torres http://lattes.cnpq.br/5355326097001242 http://lattes.cnpq.br/5785470863950566 Naveca, Felipe Gomes http://lattes.cnpq.br/3396741165569463 Ramasawmy, Rajendranath http://lattes.cnpq.br/3420417277915974 Saito, Daniel http://lattes.cnpq.br/9653041674065765 https://orcid.org/0000-0003-1259-9738 Epidemiologia - Pesquisa Neoplasia peniana Pesquisa sociodemográfica Papilomavírus Vírus Epstein-Barr CIÊNCIAS DA SAÚDE Câncer de pênis Epidemiologia Viroma Metagenoma Amazonas O Câncer de pênis apresenta alta incidência no Brasil, sobretudo nas regiões Norte e Nordeste. De etiologia heterogênea, pode estar relacionado à infecção pelo HPV ou por outros mecanismos moleculares. Neste estudo, A infecção pelo HPV foi observada em 45% dos casos. A infecção pelo EBV foi 30% e 25% apresentavam co-infecção com HPV. A análise de viroma de pacientes (HPV- e EBV-) não mostrou a presença de vírus com potencial oncogênico. Entretanto, foi observado que 99% de sequência mapearam com genoma humano, possibilitando a avaliação de múltiplas alterações genéticas. Penile cancer is not an uncommon neoplasm in developing countries. Brazil appears among the countries with high incidence - particularly in the North and Northeast. The etiology of this neoplasm appears to be multifactorial; phimosis, retention of smegma, inflammatory processes, zoophilia, smoking, infection with oncogenic viruses such as Human papillomavirus (HPV) and Epstein-Barr virus (EBV) may be associated with the onset of cancer. The application of next generation sequencing (NGS) is a promising strategy in the discovery of potentially oncogenic virus in tumor tissue. Objectives: In order to understand the profile of penile cancer patients in the region, this study aimed to describe the sociodemographic, behavioral, clinical and viroma characteristics of penile cancer patients treated at a public oncology referral hospital in Manaus, Amazonas - Brazil. Methods: Forty-seven patients diagnosed with penile cancer from 2013 to 2018 were included in the study. Initially screening for oncogenic viruses (HPV and EBV) was performed by PCR. For the viral study by metagenomics we used the protocol NetoVIR - Novel enrichment technique of VIRomes. Results: The mean age of patients at the time of diagnosis was 57.4 years ±SD 17.8 ranging from 20 to 90 years old. Most patients had phimosis and come from the interior of the state of Amazonas or from other states (64% and 77%, respectively). HPV infection was observed in 45% (21/47) of cases. HPV16 was detected in 13 patients (61%). Other HPV types detected were HPV 6, 11, 42, 51, 53, 68 and 44/55. EBV infection was observed in 30% (14/47) of the patients with PC. The p16INK4a overexpression was observed exclusively in HPV 16 positive cases and four HPV negative cases. In the survival analysis, the follow-up time was 35.4 months/patient. The mortality rate during the follow up time was 38%. Thirteen patients with penile cancer non-HPV/EBV-associated were submitted viral metagenomic analysis. Bioinformatics analysis of high-throughput sequencing for virus detection combined two existing workflows which resulted in a range of 190-2,232 reads (< 0.1%) by Kraken and 458,189 – 1,277,735 reads (~6%) by Kaiju – RVDB. Interestingly, between 10-70% of the sequences remained unclassified, suggesting the potential of high throughput metagenomic sequencing studies, such as ours, to identify new microorganisms possibly related to cancer. Conclusions: Penile carcinogenesis has heterogeneous etiology and could be assigned HPV infection or molecular mechanisms independent of HPV. In this study, 27% (13/47) patients with penile cancer non-HPV/EBV-associated were analyses by NGS. Most of the DNA sequencing was found to represent unclassified sequences. As the bioinformatics analysis showed ~99% sequences to map against the human genome, it becomes possible to assess multiple genetic alterations and maybe to predict of outcome in penile cancer. 2020-10-30T21:26:21Z 2019-12-06 Tese MARTINS, Valquíria do Carmo Alves. Característica sociodemográfica, epidemiológica, clínica e o viroma de pacientes com câncer de pênis do Estado do Amazonas. 2019. 121 f. Tese (Doutorado em Imunologia Básica e Aplicada) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019. https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7989 por Acesso Aberto application/pdf Universidade Federal do Amazonas Instituto de Ciências Biológicas Brasil UFAM Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada
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