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Dissertação
Desenvolvimento de marcadores SNPs e relação de parentesco em Potamotrygon wallacei (raia cururu) usando sequenciamento de próxima geração
A raia Potamotrygon wallacei (Carvalho, Rosa e Araújo, 2016), conhecida popularmente como “cururu”, está entre as menores arraias de água doce conhecidas. O tamanho, forma corporal e a presença do clásper parecem ser as únicas características que expressam dimorfismo sexual. Esta espécie habit...
Autor principal: | Silva, Larissa Emily Santos da |
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Outros Autores: | http://lattes.cnpq.br/7722982558701971 |
Grau: | Dissertação |
Idioma: | por |
Publicado em: |
Universidade Federal do Amazonas
2023
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Assuntos: | |
Acesso em linha: |
https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/9764 |
Resumo: |
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A raia Potamotrygon wallacei (Carvalho, Rosa e Araújo, 2016), conhecida popularmente como
“cururu”, está entre as menores arraias de água doce conhecidas. O tamanho, forma corporal e
a presença do clásper parecem ser as únicas características que expressam dimorfismo sexual.
Esta espécie habita as águas escuras dos igapós e igarapés no estado do Amazonas, sendo
endêmica da bacia do Rio Negro. Sua gestação é vivípara e pode se estender por três a seis
meses, com maturidade sexual se iniciando a partir dos dois ou três anos de idade, apresenta
baixo número de prole e longevidade alta. O conhecimento da biologia reprodutiva da raia
cururu é limitado quanto ao parâmetro do sistema de acasalamento que é atualmente
desconhecido. Este trabalho teve como objetivo, desenvolver marcadores moleculares do tipo
SNP específicos para Potamotrygon wallacei utilizando sequenciamento de próxima geração e
testar paternidade múltipla na espécie. As amostras utilizadas no trabalho foram de seis grupos
familiares, em sua maioria compostos por provável mãe e prováveis filhotes, provenientes da
localidade de Barcelos (Lago do Cubá), no Médio Rio Negro. As extrações de DNA dos tecidos
dos indivíduos foram realizadas pelo método de CTAB 2% (Cetyl Trimethyl Ammonium
Bromide). A biblioteca genômica foi processada no sequenciador de Nova Geração (Next
Generation Sequencing - NGS) Illumina, usando protocolo desenvolvido no laboratório. Os
índices de diversidade genética foram inferidos no programa Arlequin e as análises de relação
de parentesco foram feitas no software NGSRelate. A obtenção dos 1.664 marcadores SNPs via
ddRAD usando protocolo caseiro para o sequenciador de próxima geração mostrou ser
excelente para a obtenção dos níveis de diversidade genética para P. wallacei. Os resultados
sobre análise de parentesco forneceram novos insights sobre a biologia reprodutiva da arraia
cururu apresentando dois casos de sistemas de acasalamento, evidenciando um com indicativo
de monogamia e outro com indicativo de contribuição extra-par. |